Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPDL3AQ92484 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPDL3AQ92484 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms