Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
CTTNBP2Q8WZ74 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CTTNBP2Q8WZ74 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CTTNBP2Q8WZ74 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
CTTNBP2Q8WZ74 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms