Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DNAAF4Q8WXU2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DNAAF4Q8WXU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms