Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGB4Q8WW32 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB4Q8WW32 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMGB4Q8WW32 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms