Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
RB1CC1Q8TDY2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RB1CC1Q8TDY2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
RB1CC1Q8TDY2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
RB1CC1Q8TDY2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms