Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGARPQ8TDB4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MGARPQ8TDB4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGARPQ8TDB4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms