Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF398Q8TD17 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF398Q8TD17 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms