Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HELBQ8NG08 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELBQ8NG08 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELBQ8NG08 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms