Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC24A4Q8NFF2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC24A4Q8NFF2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms