Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARRDC4Q8NCT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARRDC4Q8NCT1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARRDC4Q8NCT1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
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