Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HJURPQ8NCD3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HJURPQ8NCD3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HJURPQ8NCD3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms