Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AVL9Q8NBF6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AVL9Q8NBF6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AVL9Q8NBF6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms