Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM71DQ8N9W8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM71DQ8N9W8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms