Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T3

ARFGAP1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP1Q8N6T3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFGAP1Q8N6T3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGAP1Q8N6T3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFGAP1Q8N6T3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms