Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NME8Q8N427 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NME8Q8N427 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME8Q8N427 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
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