Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PROM2Q8N271 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PROM2Q8N271 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PROM2Q8N271 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms