Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD3Q8N144 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD3Q8N144 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms