Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A9Q8IVM8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A9Q8IVM8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A9Q8IVM8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms