Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CLASP1Q7Z460 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
CLASP1Q7Z460 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CLASP1Q7Z460 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLASP1Q7Z460 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms