Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUFY3Q7L099 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY3Q7L099 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY3Q7L099 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms