Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27LQ71UM5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS27LQ71UM5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms