Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP50Q70EL3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP50Q70EL3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP50Q70EL3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms