Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAXIP1Q6ZW49 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAXIP1Q6ZW49 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAXIP1Q6ZW49 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms