Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO4Q6UY18 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINGO4Q6UY18 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINGO4Q6UY18 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms