Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM1Q6UX27 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms