Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO3Q6UWJ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO3Q6UWJ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO3Q6UWJ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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