Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASC1Q6TDU7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CASC1Q6TDU7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CASC1Q6TDU7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms