Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO38Q6PIJ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO38Q6PIJ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO38Q6PIJ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms