Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8BQ6P9F7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms