Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCSD1Q6JBY9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RCSD1Q6JBY9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms