Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENND4CQ5VZ89 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms