Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM208BQ5VWN6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM208BQ5VWN6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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