Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms