Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
C12orf60Q5U649 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C12orf60Q5U649 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms