Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HES3Q5TGS1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HES3Q5TGS1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms