Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOGA3Q5TF21 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SOGA3Q5TF21 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SOGA3Q5TF21 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SOGA3Q5TF21 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms