Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RSPH4AQ5TD94 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RSPH4AQ5TD94 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RSPH4AQ5TD94 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RSPH4AQ5TD94 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RSPH4AQ5TD94 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms