Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRTP1Q5TC63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRTP1Q5TC63 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms