Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C10orf55Q5SWW7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms