Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATAT1Q5SQI0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms