Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1BQ53T94 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF1BQ53T94 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF1BQ53T94 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms