Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN52Q52LA3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN52Q52LA3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN52Q52LA3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms