Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKDCCQ504Y2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKDCCQ504Y2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms