Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A12Q504Y0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC39A12Q504Y0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC39A12Q504Y0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms