Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COX19Q49B96 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX19Q49B96 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX19Q49B96 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX19Q49B96 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX19Q49B96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX19Q49B96 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX19Q49B96 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX19Q49B96 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX19Q49B96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms