Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCB5Q2M3G0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCB5Q2M3G0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB5Q2M3G0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB5Q2M3G0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB5Q2M3G0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms