Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TXNRD1Q16881 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TXNRD1Q16881 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TXNRD1Q16881 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms