Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLPPQ16740 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLPPQ16740 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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