Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK4Q16099 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK4Q16099 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK4Q16099 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms