Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85BQ15834 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85BQ15834 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85BQ15834 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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